自行開車(南下)
北部 / 中南部
北部及中南部遊客，可經由國道三號南下，由林邊交流道出，往東港方向行駛，直走台17 線，直行進入東港至進德橋前左轉，前行約200公尺右側，抵公營、民營碼頭。北部 / 中南部 北部及中南部遊客，可經由國道一號高速公路南下，由小港機場出口沿省道十七號公路，往東港行駛即抵達東港碼頭。
北部 / 中南部
北部及中南部遊客，可經由國道一號高速公路南下，由小港機場出口沿省道十七號公路，往東港行駛即抵達東港碼頭。
高雄
高雄旅客，可經台17線(沿海路)經過林園至東港，過東港大橋前行第二個紅綠燈右轉光復路，至中山路右轉至進德橋前左轉，前行約200公尺右側，抵公營、民營碼頭。
屏東
屏東旅客，可經台27線往萬丹、烏龍，左轉台17線往東港，過東港大橋前第二個紅路燈右轉光復路，中山路右轉至進德橋前左轉，前行約200公尺右側，抵公營、民營碼頭搭船。
自行開車(北下)
台東 / 墾丁
由台東、墾丁前往東港者 自墾丁沿26號省道至枋寮、水底寮，再沿17號省道至林邊、東港， 抵達東港後再至東港碼頭。
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大眾交通系統
航空機場
高雄小港機場：轉搭國光、屏東、高雄或中南客運至東港，再至東港碼頭。
客運系統
(國光客運、中南客運、高雄客運、屏東客運)搭乘「高雄←→恆春、墾丁」班車(路線：高雄→小港→林園→東港)，車程約60-90分鐘，乘車處於舊高雄火車站高市願景館對面，抵達東港後再至東港碼頭(步行約10分鐘)。
屏東客運
搭乘「屏東←→東港」班車(路線：屏東→公館→新園→烏龍→東港)，車程約45-60分鐘)，屏東乘車處於火車站旁屏東客運總站，抵達東港後再至東港碼頭(步行約10分鐘)。